گزارش گونه‏های نوکاردیای جدا‏سازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶s rrna، اصفهان، ایران

نویسندگان

شراره مقیم

سمانه بوربور

دانشجوی دکترای تخصصی میکروب‏شناسی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، ایران جمشید فقری

اصفهان-خیابان هزار جریب-دپارتمان میکروبشناسی و ویروس شناسی-دانشگاه علوم پزشکی اصفهان- کد پستی:73461-81746

چکیده

مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیست‏های هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتری‏های ساکن خاک را شامل می‏شوند، که در جهان پخش شده‏اند. در این مطالعه، با استفاده از آزمون‏های تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزوله‏های نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش‏‏ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش slip-buried و برای استخراج dna، روش microwave oven استفاده شد و در این روش‏ها، سویه استاندارد dsm 43757 nocardia asteroides استفاده شد. در ادامه، روش pcr با استفاده از پرایمرهای عمومی انجام شد. نتایج: با تحلیل اطلاعات فنوتیپی و مولکولی، به‏ویژه تعیین توالی ژن 16s rrna، ژن‏های نوکاردیای‏های جداسازی شده از خاک اصفهان، که در ادامه به آن‏ها اشاره شده است، درپایگاه داده ncbi باaccession number مربوط به هر ژن ثبت شدند. نوکاردیاهای ثبت شده در ncbi: nocardia cyriacigeorgica kc577151, nocardia asteroides kc577152, nocardia cummidelens kc577153, nocardia asteroides kc577155, nocardia asteroides kc577155, nocardia coubleae kc577156 .. بحث و نتیجه‏گیری: در این پژوهش 6 گونه نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد، که برخی از این گونه‏های جداسازی شده از خاک ایران، اصفهان، در زمان جداسازی و تشخیص،گونه‏های جدیدی بودند. برای تشخیص بیشترگونه‏های مختلف نوکاردیا می‏توان در مطالعات بعدی از تکثیر و تعیین توالی ژن‏های دیگر این باکتری از جمله its,hsp65 seca, rpob  و sod بهره گرفت.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

گزارش گونه‏ های نوکاردیای جدا‏سازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن 16S rRNA، اصفهان، ایران

مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیست‏های هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتری‏های ساکن خاک را شامل می‏شوند، که در جهان پخش شده‏اند. در این مطالعه، با استفاده از آزمون‏های تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزوله‏های نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش ‏‏ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روش‏ها، سو...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی جنسcrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن ۱۶s rrna

16s rrna یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله ی ژنوم میتوکندریایی کد می شود و به طور گسترده ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به crassostrea مورد استفاده قرار می گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16s rrna ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...

متن کامل

جداسازی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و شناسایی آن بر اساس تعیین توالی ۱۶s rrna

سابقه و هدف: استافیلوکوکوس سیمولانس یک کوکسی گرم مثبت و خوشه ای می باشد که از پوست، ادرار و نمونه های بالینی انسان و حیوان به ویژه عفونت پستان گاوی جداسازی شده است. این پژوهش با هدف جداسازی و شناسایی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و نیز معرفی آن به عنوان یک عامل درمانی جدید در درمان عفونت های استافیلوکوکی انجام شده است.  مواد و روش ها: این پژوهش به صورت...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی جنسCrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن 16S rRNA

16S rRNA یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله‌ی ژنوم میتوکندریایی کد می‌شود و به طور گسترده‌ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه‌های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به Crassostrea مورد استفاده قرار می‌گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16S rRNA ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (Crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...

متن کامل

بررسی فیلوژنی سویه‌های سالمونلای جدا‌شده از نمونه‌های بالینی بیمارستان‌های تهران براساس تعیین توالی ژن 23S rRNA

زمینه و هدف: باکتری سالمونلا یکی از مهم‌ترین عوامل گاستروانتریت باکتریایی و بیماری‌های ناشی از غذا است. تاکنون بیش از ۲۵۰۰ سرووار از این جنس شناسایی‌شده که اکثر آنها برای انسان بیماری‌زا هستند. ساختار فیلوژنی خانواده انتروباکتریاسه براساس توالی ۱۶S rRNA تنوع وسیعی ندارد. بنابراین این ژن به دلیل میزان توالی بالای حفاظت‌شده در ساختار خود، نمی‌تواند مشکلات طبقه‌بندی را در گونه‌های نزدیک به هم حل ک...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
زیست شناسی میکروارگانیسم ها

جلد ۴، شماره ۱۶، صفحات ۳۳-۴۲

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023